Евгений, здравствуйте!
Для управления модулем при звонке используется DTMF модуляция, или если по-простому, то тональный набор.
Подробнее про DTMF можно почитать здесь:
http://ru.wikipedia.org/wiki/DTMF
Возможно Ваш телефон генерирует DTMF сигнал с ошибкой. Также возможно, что модуль находится в зоне "неуверенного" приема и качество связи не позволяет корректно распознать команду.
Предлагаю проверить следующее:
1. Отправьте команду 09 на номер модуля и убедитесь, что значение уровня сигнала GSM больше 10.
2. Позвоните на номер SIM-карты, установленной в модуль, с другого телефона, например, со стационарного. Наберите несколько команд и оцените качество распознавания.
С уважением, Сергей.