С родного ключа при включенном зажигании замки запираться не будут. Это особенность автомобиля. CAN- модуль, установленный у Вас, не управляет центральным замком при включенном зажигании. Советую поменять его на
http://www.ultrastar.ru/4765/4776. Он решит все Ваши проблемы. Кроме того, в нем реализованы дополнительные сервисные функции- запирание дверей при начале движения, комфорт.